Program Doktor dalam Fisika didirikan dengan tujuan untuk menghasilkan lulusan doktor di bidang Fisika yang memiliki integritas dan dedikasi terhadap pengembangan fisika, baik fisika dasar maupun fisika terapan, yang bekerja baik secara teoritis maupun eksperimental / pengamatan.
Empat Bidang Kelompok Keahlian (KBK) di Departemen Fisika, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam UGM sebagai berikut:
Sebagian besar lulusan memiliki karir di bidang akademik sebagai dosen di universitas negeri dan swasta, atau menjadi guru di pendidikan menengah, sementara yang lain menjadi peneliti di berbagai lembaga penelitian milik pemerintah atau menjadi ahli di lembaga pemerintah atau perusahaan swasta nasional. Beberapa dari mereka menjadi wirausaha berdasarkan sains-teknologi.