Program Studi Magister Ilmu Komputer (Magister Ilmu Program Komputer) adalah pendidikan berorientasi akademik yang didirikan pada tahun 1999. Lulusan program Master Ilmu Komputer memperoleh gelar M.Cs (Magister Ilmu Komputer). Master of Computer Science telah dikenal secara nasional dan internasional, diwakili oleh mahasiswa multi-etnis yang berasal dari berbagai pulau di Indonesia (dari Sabang hingga Merauke) serta dari luar negeri. Pada Desember 2018, Program Magister Ilmu Komputer telah menghasilkan lebih dari 1.000 lulusan.
Lulusan Program Magister Ilmu Komputer dapat bekerja, antara lain, sebagai: